研究人员使用全基因组测序(WGS)来证明在加利福尼亚州北部一家医院中携带碳青霉烯抗性基因的单一细菌菌株的传播。该基因使这种细菌具有抗碳青霉烯类的能力，碳青霉烯是一种抗菌药物，可作为严重感染的最后一种治疗方法。该研究于6月23日星期日在美国微生物学会年会ASM Microbe上发表。
来自当地公共卫生部门和加州公共卫生部(CDPH)的流行病学专家与CDPH微生物疾病实验室(MDL)的实验室科学家合作，对流行病学特征进行了表征，并结合流行病学信息确定潜在的传播途径。
细菌菌株在医院中持续存在超过3年，可能是由于从患者到患者的传播以及在医院重症监护病房(ICU)中的长时间停留。“我们的研究强调了定期对医院耐药菌株进行流行病学和微生物监测的重要性，以及使用先进的分子技术追踪它们的传播，”Varvara Kozyreva博士说。加州公共卫生部微生物疾病实验室计划基因分型科长。
在2013年至2015年期间，该医院确定了8名患有肺炎克雷伯氏菌菌株阳性的患者，这些菌株产生了一种赋予碳青霉烯类耐药性的酶。最初的4名患有耐药菌株的患者在一个月内在ICU中重叠停留。这些初始患者中的一个留在ICU中两年，在此期间在该设施中发现另外四名具有抗性细菌菌株的患者。来自8位不同患者的细菌的WGS分析证明它们都是遗传上高度相关的。
“WGS让我们能够理解并证明患者在多年的时间段内的联系，而单凭流行病学信息是不可能的，”Kozyreva博士说。WGS还表明，这种特殊的细菌菌株的碳青霉烯抗性基因似乎位于染色体上。通常，这种抗性基因位于称为质粒的其他“移动”DNA片段上，可以在不同菌株(甚至不同物种)之间转移。
“由于这种特殊菌株在医院环境中与其他细菌有效分享其碳青霉烯类抗性基因的手段较少，因此这一抗生素抗性克隆细菌更有可能在医院中持续多年，”博士说。 .Kozyreva。使用WGS跟踪抗性细菌菌株可以帮助医院和公共卫生官员针对感染控制干预措施更快地停止传播。